EQMS (Enterprise Quality Management System) הוא סוג מערכת שמנהלת את כל היבטי איכות המוצר או השירות בארגון: תהליכי בדיקה, אודיטים פנימיים וחיצוניים, ניהול אי-התאמות (Non-Conformances), CAPA (Corrective and Preventive Actions), בקרת מסמכים, והתאמה לתקנים כמו ISO 9001, ISO 13485, ואחרים.
הקטגוריה קריטית במיוחד בתעשיות מפוקחות: מכשור רפואי (FDA, MDR), תרופות (GMP), מזון (FSSC 22000), אווירונאוטיקה (AS9100), ובנקאות (Basel III). בישראל — חברות ביומד ומכשור רפואי (Medtronic Israel, Insightec, Nanox) הן צרכניות משמעותיות של EQMS ברמה גבוהה.
ספקים מובילים: MasterControl, ETQ Reliance, Sparta Systems, ואחרונה גם כלים ישראליים (חלקם מבוססי no-code). ההטמעה טיפוסית — 6–14 חודשים, עלות שנתית 40,000–200,000 ₪ לרישוי בהתאם למספר משתמשים ומודולים. הצלחת ההטמעה תלויה בעיקר בשילוב הצוות הפנימי של איכות עם התהליכים היומיומיים.